中央认为，深化供销合作社改革的总体思路是：从农村经济发展的需要、从建立社会主义市场经济体制的要求、从供销合作社自身改革的迫切需要出发，紧紧围绕把供销合作社真正办成农民的合作经济组织这个目标，抓住理顺组织体制、强化服务功能、完善经营机制、加强监督管理和给予保护扶持等五个环节，以基层社为重点，采取切实有力的政策措施，使供销合作社真正体现农民合作经济组织的性质，真正实现为农业、农村和农民提供综合服务的宗旨，真正成为加强党和政府与农民密切联系的桥梁和纽带。 

    （一）供销合作社组织体制 
    供销合作社分基层社，县、市联合社，省、自治区、直辖市联合社，全国总社。各级供销合作社之间是自下而上的经济联合关系，内部实行联合社为成员社服务、各级联合社为基层社服务的原则。联合社对成员社负有指导、协调、监督和教育培训人员的责任

    （二）供销合作社管理制度 
    供销合作社实行代表会议制，设立理事会和监事会。理事会和监事会要有一定比例的社员代表参加。领导成员实行民主选举，职工实行招聘合同制，重大决策实行民主协商，经营管理实行民主监督，充分体现民主性。各级供销合作社的日常工作实行理事会主任负责制。理事会的主要职能是，对成员社进行业务指导，协调与政府部门、社会组织的关系，行使本级社有资产出资人代表职能，监督社有资产保值增值，并按出资额依法享有所有者的资产受益、重大决策和选择管理者的权利。

    （三）供销合作社与农民社员的关系 
     按照自愿的原则，争取更加广泛的农民群众入社，充分体现它的群众性。要坚持农民入社自愿、退社自由，绝不能搞强迫命令。

    (四）供销合作社内部管理与经营机制 
     供销合作社内部应实行多种形式的经营责任制，不断增强市场竞争意识，搞活企业经营，加强企业管理，提高经济效益。无论实行哪一种经营责任制，都不得改变它的集体所有制性质，都必须确保资产的保值增值，确保社员  的经济权益。要进一步改革分配制度，打破‘铁饭碗’和平均主义。

    （五）供销合作社所属企业管理 
     各级供销合作社所属企业是独立的企业法人，拥有经营、用工、分配等自主权，实行自主经营、自负盈亏、自我发展、自我约束。

     (六）供销合作社职工队伍建设 
    各级供销合作社都要把职工队伍建设作为一项基础工作来抓。要加强思想政治工作，关心职工生活，保障职工权益，稳定职工队伍。要办好各类专业院校和培训中心，加强在职职工的业务、技术培训和职业道德教育。要深化劳动用工制度的改革，管理人员实行招聘制，职工实行劳动合同制，对专业技术人员按照国家有关规定评定技术职称。要广泛吸收各类优秀人才，优化人才结构，提高职工队伍素质、更好地肩负起供销合作社的历史重任。